树之魂 -植物猎人-时间是19世纪——东南亚。植物采集家诺亚拥有从植物的根里读取记忆的「起源追想」的特殊能力。处于起源追想中时，一旦脱离了植物，精神就会被根所夺走，人也会死。他的助手兼护卫拉杰特是个前海贼。他拥有能做海贼护卫的剑术。两人接受了蒂巴商会采集植物的委托，为了寻找稀有植物而环游世界!